Читайте Данченко - "Принципиальные вопросы общей теории чакр"
Если в двух словах, то будет примерно так:
Ограничение входящих сигналов и прекращение внутреннего диалога приводит к тому, что мыслящая часть мозгов однажды начинает воспринимать сигналы идущие из спинного мозга. А сигналы показывающие состояние разных органов (и соответствующий встречный - управляющий поток сигналов) оттуда идут постоянно и обильно. В какой форме предстаёт перед внутренним взором этот поток - отдельная большая тема для разговора.
Теперь собственно о чакрах. Очевидно, что мозг различает сигналы приходящие, скажем, от сердца и от печени. Все входящие сигналы можно сгруппировать по местоположению нервных окончаний их собирающих. Скажем, можно выделить группу сигналов, идущую от органов брюшной полости - вот вам и чакра соответствующая. Как физические объекты чакры не существуют. Каждая чакра это просто группа сигналов, собираемая тем или иным отделом спинного мозга. Таким образом имеем как бы "внутренний телевизор" с несколькими каналами (чакрами). "Переключение" же "каналов" осуществляется соответствующей направленностью внимания - внутреннего взора. Естественно имеет место влияние наблюдателя на наблюдаемые процессы, откуда и происходят разного рода сбои функционирования организма наблюдателя.